Generalforsamlingen er Blå Kors sitt øverst organ og møtes annet hvert år. Her behandles blant annet budsjett og strategisk plan.
Blå Kors Norge ledes av landsstyret, som blant annet tilsetter generalsekretær.
Generalsekretær har det operative ansvaret for Blå Kors Norge.
Medlemmer av Blå Kors landsstyre for perioden 2024-2026:
Torbjørg Aalborg (landsstyreleder), Oslo
Egild Homme (nestleder), Ålesund
Reidar Andestad, Molde
Kjersti Egenberg, Stavanger
Gina Viviann Gjerme, Bergen
Erling Ekroll, Oppegård
Christian Sohlberg, Oslo
Silje Kvamme Bjørndal, Oslo
Tonje Haugjord Refsnes, Evje
Varamedlemmer:
Elisabeth Ege, Bærum
Svend Aspaas, Oslo
Jon Håkon Øen, Os
Styremedlemmer av Blå Kors Ung for perioden 2022-2024:
Tonje Haugjord Refsnes (leder), Evje
Trygve Netland (korpssjef), Bryne
Bente Kristine Kvalheim, Kristiansand
Amy Tangen, Karmøy
Siri Haugsdal, Sotra
Varamedlemmer:
Ida Marie Thornes Høitorp, Vennesla
Tora Svennevik, Sotra